Le décompte TVA de toute entreprise assujettie repose sur deux choix indépendants : le moment où la TVA est déclarée (le mode de décompte) et la manière dont le montant dû est calculé (la méthode de décompte).
1. Quand : le mode de décompte
2. Combien : la méthode de décompte
Chaque mode de décompte peut être combiné avec chacune des méthodes. Un cabinet de conseil peut par exemple décompter selon les contre-prestations reçues avec la méthode des taux de la dette fiscale nette, tandis qu'une entreprise aux achats ou aux investissements importants reste en général à la méthode effective.
En pratique, le mode de décompte détermine les pièces qui alimentent le décompte : les factures émises et reçues, ou les paiements encaissés et effectués, tels qu'ils figurent sur les relevés bancaires. La méthode détermine si l'impôt préalable doit être suivi facture par facture.